1、利用不同的培養(yǎng)基和不同的富集方法分離獲得硫氧化細菌、鐵還原細菌、硫酸鹽還原菌、真菌、放線菌901株，鑒定發(fā)表16株細菌新種。對100多株初選菌株進行了液體發(fā)酵，篩選到15株高效抑制黃曲霉毒素產(chǎn)生的菌株。開展產(chǎn)油真菌篩選，獲得60株產(chǎn)油真菌。

2、調(diào)查和分析了西南印度洋及西北印度洋39個樣品的微生物群落結(jié)構(gòu)多樣性及其與環(huán)境因子相關(guān)性。初步解析鐵還原菌Kocuria sp. FXJ8.057三價鐵還原機理；完善了微生物單細胞基因組微體積擴增和分析平臺。

3、在大洋32航次開展現(xiàn)場微生物分樣和培養(yǎng)實驗,獲得9個未培養(yǎng)微生物的基因組片段。分離結(jié)核結(jié)殼區(qū)微生物800余株，發(fā)現(xiàn)并發(fā)表15個微生物新種。測序獲得3個基因組完成圖。

4、從西南印度洋熱液口多金屬硫化物中分離嗜熱噬菌體，提取并擴增噬菌體基因組，進行宏基因組測序。

5、建立了基于發(fā)酵條件優(yōu)化與色譜和波譜為導(dǎo)向的深海微生物菌株的培養(yǎng)方法；建立了發(fā)酵物的快速前處理與代謝產(chǎn)物的快速萃取技術(shù)。完成了100株海洋微生物代謝產(chǎn)物指紋圖譜的分析、300株微生物餾分制備、500株微生物培養(yǎng)物的HPLC-DVD分子指紋圖。對20株微生物進行系統(tǒng)的化學(xué)成分研究,分離并鑒定了114種特殊結(jié)構(gòu)的深海天然產(chǎn)物的結(jié)構(gòu),其中70種為新穎結(jié)構(gòu)化合物.

6、完成了對800多株海洋微生物代謝產(chǎn)物的分析整理工作，并逐步建立線上多方共享的深海細菌化學(xué)指紋圖譜數(shù)據(jù)庫平臺。發(fā)現(xiàn)7株活性菌株，從中分離到具有生物活性的新化合物24個。

7、克隆了21個編碼潛在藥物靶點的基因至哺乳類細胞表達及果蠅與斑馬魚轉(zhuǎn)基因載體。

8、從來源于不同海域（印度洋、大西洋、南海）不同生境環(huán)境（海水、沉積物）樣品中分離出300余株深海微生物菌株。

9、構(gòu)建了2個深海沉積物宏基因組文庫。

10、從大西洋等不同海域樣品中分離得到7個海洋細菌新種（屬），完成了系統(tǒng)鑒定工作；基于基因組信息提出了劃分微生物屬的界限標準。

11、從大洋樣品中分離、純化、產(chǎn)電微生物，研究其形態(tài)特征、生理生化特征并進行鑒定；采用不同的電子供體，考察特異性菌株或菌群脫氯、脫硝、脫鈾行為；考察底物濃度及對產(chǎn)電微生物的代謝行為的影響，考察微生物燃料電池運行穩(wěn)定性。